L’objectiu de l’avaluació operativa és l’anàlisi dels progressos realitzats als diferents programes operatius mitjançant l’anàlisi de la qualitat i pertinència dels objectius proposats, l’avanç físic i financer, l’eficàcia i l’eficiència dels programes operatius, etc. Amb aquest objectiu s’ha dissenyat un sistema ambiciós d’indicadors i un complex sistema informàtic de gestió.