Per presentar el projecte per al seu finançament amb el Fons, cal remetre una sol•licitud d'ajuda on constin els requisits especificats en l'Article 10 del Reglament 1164/1994, adjuntar a la proposta dels Estats una avaluació a priori, que permeti als països justificar la selecció dels projectes i explicar l'impacte que tindran sobre el medi ambient.
La Comissió comprovarà que es compleixen totes les condicions per aprovar un finançament del Fons de Cohesió. Per a això, es tenen en compte els criteris recollits en l'art. 10.5 del Reglament:
- els avantatges econòmics i socials a mig terme del projecte, demostrades per una anàlisi de costos i beneficis o cost-eficàcia;
- la participació del projecte en l'assoliment dels objectius comunitaris per al medi ambient o la Xarxa transeuropea de transport;
- el respecte de les prioritats establertes per l'Estat membre;
- la compatibilitat del projecte amb la resta de polítiques de la Comunitat i, per tant, amb les accions promogudes pels Fons Estructurals comunitaris.
Les sol•licituds hauran de ser tramitades per l'Administració responsable de l'execució del projecte a través de la Unitat Gestora del Fons de Cohesió, dependent de la Direcció General de Fons Europeus, del Ministeri d'Economia i Hisenda
A través d'aquesta Unitat es coordina tot allò relatiu a la gestió del Fons, incloent la formació de la cartera de projectes a presentar per al seu finançament amb la dotació del Fons per a cada any i la tramitació de les sol•licituds davant la DG Regio de la Comissió Europea.
Aquí pot descarregar un fitxer amb el formulari de sol•licitud d'ajut:
- Sol•licitud d'ajuda per a un projecte, del Fons de Cohesió.
- Sol•licitud d'ajuda per a un grup de projectes, del Fons de Cohesió.
Els formularis de sol•licitud incorporen 4 Annexos: Annex I, de documentació ambiental, Annex II, de procediment de contractació, Annex III, d'anàlisi econòmica i financera, i Annex IV, Guia d'informacions específiques de projectes de Medi Ambient i de Transports. Per a complementar l'Annex III es pot consultar la següent nota metodològica: Archivo formato pdf nota metodològica , el document de la Comissió Europea: Archivo formato pdf Guide to cost-benefit analysis of investment projects. (Guia per a l'anàlisi cost-beneficis.) i la nota del 14/04/03 de la Comissió Europea: "Simplificació, transparència i coherència en l'avaluació dels grans projectes d'infraestructures públiques : Aplicació de quatre normes bàsiques".
La Comissió Europea pren les decisions d'aprovació d'ajuda del Fons per als projectes i comunica les seves decisions a l'Estat Membre (Cfr. Art. 10.6 Reglament 1164/1994). En el cas d'Espanya, ho comunica a través de la Direcció General de Fons Europeus (Subdirecció General de Fons de Compensació i Cohesió) del Ministeri d'Economia i Hisenda.