O obxectivo da avaliación operativa é a análise dos progresos realizados nos diferentes Programas Operativos (P.Ou) mediante a análise da calidade e pertinencia dos obxectivos propostos, o avance físico e financeiro, a eficacia e eficiencia dos P.Ou etc. Con este obxectivo deseñouse un ambicioso sistema de indicadores e un complexo sistema informático de xestión.