La politique régionale développée par l'Administration Générale de l'État est appliquée par le biais de différents instruments. Les plus importants sont, de par leurs caractéristiques et leur importance économique, les suivants : Les Fonds Structurels Européens; Le Fonds de Compensation Interterritoriale; Les aides d'état à finalité régionale; La Coopération Locale de l'État
Parmi ces instruments de la politique régionale, les plus importants, pour leur dimension financière, sont lesFonds Structurels Européens. L'Espagne a perçu entre les années 2000 et 2006 un total de 60.752 millions d'euros (de 2004) et elle va percevoir 31.543 millions d'euros (de 2004) pendant la période 2007-2013.
L'application des Fonds Structurels Européens dans les régions sélectionnées pour chaque Objectif se base sur un ensemble de documents de programmation pluriannuelle, élaborés par l'État espagnol, qui doivent être approuvés par la Commission Européenne.