L'IFOP a pour mission de contribuer à atteindre l'équilibre entre les ressources du secteur de la pêche et leur exploitation. Il vise également à renforcer la compétitivité du secteur et le développement des zones qui en dépendent.
Champs d'action de l'IFOP: ajustements des efforts de pêche; développement de l'aquaculture; modernisation de la flotte.