Les évaluations intermédiaires, effectuées au milieu de la période de programmation, sont essentielles pour évaluer le fonctionnement des programmes et, le cas échéant, reprogrammer et modifier les procédures de gestion jugées opportunes. Ces évaluations sont réalisées par des experts en évaluation qui sont indépendants des administrations publiques des États membres ainsi que de la Commission européenne. Sont évalués les cadres communautaires d’appui ainsi que tous les programmes opérationnels et les DOCUP (documents uniques de programmation) en cours d’exécution.