Comme pour la période 1993-1999, les quatre pays bénéficiaires pour 2000-2006 sont l'Espagne, le Portugal, l'Irlande et la Grèce. Nonobstant, avant la fin 2003, le droit aux subventions pour ces pays doit être réexaminé sur la base des avancées obtenues et des indicateurs socio-économiques mis à jour.
Le pourcentage du budget alloué à chaque État est le suivant : Grèce16-18%, Irlande 2-6%, Portugal 16-18%, Espagne 61-63.5%
L'enveloppe pour ce Fonds est passée de 15 milliards d'euros pour la période 1993-1999 à 18 milliards d'euros pour la période 2000-2006.
Les dotations annuelles tiennent compte du taux d'inflation de sorte qu'en termes réels, le Fonds de cohésion est toujours stable.
| Año |
2000 |
2001 |
2002 |
2003 |
2004 |
2005 |
2006 |
Total |
| Cuantía |
2.615 |
2.615 |
2.615 |
2.615 |
2.515 |
2.515 |
2.510 |
18.000 |