El objetivo de la evaluación operativa es el análisis de los progresos realizados en los diferentes Programas Operativos (P.O) mediante el análisis de la calidad y pertinencia de los objetivos propuestos, el avance físico y financiero, la eficacia y eficiencia de los P.O etc. Con este objetivo se ha diseñado un ambicioso sistema de indicadores y un complejo sistema informático de gestión.