La Comisión estableció tres principios generales en la preparación y gestión del Fondo de Cohesión modificado a partir de los Reglamentos (CE) nº 1264/99 y (CE) nº 1265/99, de junio de 1999, y que entraron en vigor el 1 de enero de 2000:Un enfoque más estratégico, una mayor racionalización del tamaño de los proyectos y de los grupos de éstos, una mayor coordinación con los demás instrumentos comunitarios, en particular con el FEDER.