Los Estados miembros elaboran los Programas Operativos del FEDER regionales y plurirregionales.
Los Programas Operativos plurirregionales en España son los siguientes:
Programa Operativo Plurirregional de España 2014-2020 (que fusiona los anteriores Programas Operativos de Crecimiento Sostenible y de Crecimiento Inteligente).
Programa Operativo Iniciativa PYME.