La aportación financiera del FEDER tiene como finalidad favorecer el proceso de convergencia de las regiones más desfavorecidas, a través de la mejora de la competitividad empresarial, y es importante, puesto que puede suponer hasta el 80% de la ayuda total concedida, permitiendo que las ayudas se destinen a los proyectos que, por su especial localización, aprovechamiento de recursos naturales de la zona y efecto dinamizador - sobre todo, los que utilicen tecnología avanzada - contribuyan al desarrollo regional.
Los Programas Operativos prestan especial atención a las pequeñas y medianas empresas que son las que se considera que mejor pueden adaptarse para crear una base sólida que permita el adecuado desarrollo del tejido productivo.